非居民的申报所得税
非居民按状况可分为：拥有持久性设施（PE）的非居住者（(a)在日本国内拥有办事处的非居民；(b)在日本国内连续一年以上从事建筑、装配的非居民；(c) 通过特定的代理人开展业务的非居民）和不拥有PE的其他非居民。但是，如与租税协定中的规定不一致，则以租税协定中的PE定义优先。
根据上述划分，就各种状况所规定范围内的所得分别计算应课税所得。此外，针对非居民所得税的课税方法为根据是否拥有PE，划分为PE归属所得及其他的国内源泉所得来进行课税。原则上，对非居民通过申报征收的所得税额的计算方法与居民相同（在可适用的所得扣除等，以及外国税额扣除的限额等方面处理方式不同）。非居民因在日本工作而获得的工资所得因在海外支付，在日本未被征收来源税者，必须申报并缴纳该工资等总额的20.42%作为税额（称为分离课税）。